De första flygplanen
Sex år senare kunde svenskar för första gången se ett flygplan i luften. Det var i juli 1909 som fransmannen Georges Legagneux visade sitt flygplan i luften ovanför Ladugårdsgärde i Stockholm. Nästan samtidigt befann sig den svenske friherren, bilhandlaren m.m. Carl Cederström i Köln där han såg flygningar som fransmannen Louis Blériot utförde. Cederström blev så intresserad att han for till Frankrike för att lära sig flyga och köpte ett flygplan. 1910 kom han tillbaka till Sverige som den förste svensk med aviatördiplom.
Flygets vagga på Malmen
När Cederstöm i juni 1911 besökte Östgötaregementenas exercisplats Malmen för att visa upp sitt flygplan gick Linköpingsborna man ur huse för att se denna begivenhet. Han fann Malmen lämplig för flygning. Då armén och marinen behövde utbilda förare till sina nyupprättade flygenheter organiserade Cederström 1912 en flygskola på Malmen.
Upptakt för ett flygvapenmuseum
Det svenska flygvapnet bildades 1926 och flygflottiljer byggdes upp över landet. Kungliga Östgöta Flygflottilj på Malmen gavs beteckningen F 3. Flygtekniken har utvecklats snabbt under 1900-talet. De framsynta flottiljcheferna vid F 3 - Gösta von Porat och Hugo Beckhammar - skapade genom envishet och enträget arbete grunden till en museisamling som skulle kunna åskådliggöra flygvapnets utveckling.
Det lokala näringslivet, bl.a. Saab och CVM (Centrala Verkstaden Malmslätt), bidrog likaså med kunskap, material, tid och pengar för uppbyggnaden av de flyghistoriska samlingarna. Även Linköpings kommun gav sitt stöd, bl.a. genom att uppföra en magasinsbyggnad i Ryd i Linköping. År 1967 öppnades samlingarna för allmänheten. Visningarna sköttes av medlemmar i den nybildade föreningen Östergötlands Flyghistoriska Sällskap (ÖFS), vars syfte var att verka för tillkomsten av ett flygvapenmuseum på Malmen.
Flygvapenmuseum - ett statligt museum
År 1977 organiserades Flygvapenmuseum i den statliga myndigheten Statens försvarshistoriska museer (SFHM). Den första utställningshallen i den nuvarande museibyggnaden på Malmen i Linköping invigdes av kung Carl XVI Gustaf i mars 1984. År 1989 invigde prins Bertil den andra hallen.
I juni 2010 invigdes Flygvapenmuseum på nytt efter sin största och mest genomgripande utbyggnad. Fr.o.m då blev vi ett kulturhistoriskt museum avsett för alla, innehållande bland annat en utställning om Sverige under kalla kriget med den bärgade DC-3:an i fokus.